臺灣的考古研究始於十九世紀末，至今超過百年，總共約發現2,000餘處的考古遺址，其中有數百處曾經過各種考古發掘與調查，藉由歷來的努力，現在已大略可以建構出臺灣史前的年代，包括從3萬年前開始的舊石器時代，約6千年開始的新石器時代，以及約2千年開始的鐵器時代。除此，還能舉出各區域的要素特徵，並推測各種文化的發生、傳承、擴散、變遷與消逝。
然而除上述外，臺灣的史前樣貌仍留下很多疑問與空白，這都是後續研究者們所須面臨的挑戰。其中，重要課題之一無疑就是與原住民古代史的銜接，他們從哪裡來？又是如何成為今日各種族群的狀態？跟上述各個時代的考古遺址有著什麼樣的關係？
尤其近代有不少島外人群來到臺灣，帶來各國的異文化，種種都直接衝擊了原本的島民，使得史前長久延續下來的文化產生劇烈的改變。
臺灣從17世紀始進入有文字記載的歷史時代，這當然對探索古代原住民的歷程受到限制。因之，考古學對此成為一門關鍵性的學問。
本課程主要從考古學角度探討臺灣原住民，課程共區分七個單元，分別是最早的臺灣人、臺灣新石器時代的開創者、史前臺灣農業的開啟、史前臺灣的與外關係、南島語族的起源地問題、族群的形成、臺灣文化群體的特質等。以考古研究成果為資料，以探討人群社會為目標。
上課形式以專題的研讀、發表、討論進行。並有校外教學活動。